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斑马鱼1号染色体全基因组敲除计划构建品系推荐

作者:zhangyun 发布时间:2018/2/28 17:09:06
      20132月,新一代基因编辑技术CRISPR/Cas9系统刚刚面世,中国的斑马鱼学界旋即自发组织“斑马鱼1号染色体全基因敲除计划联盟(ZAKOC)”,应用CRISPR/Cas9技术对斑马鱼基因组进行大规模、全染色体水平的系统性基因敲除工作,成为全球最早启动的使用该技术实施模式动物全基因组水平敲除的研究计划。ZAKOC包含全国38家实验室,采取自愿参加、自筹经费的模式,对斑马鱼1号染色体上的1333基因进行系统敲除(ZKO项目)。

  斑马鱼基因组大小约1.5Gb,共含有25条染色体,约32000个基因。其中,1号染色体大小约60Mb,含有1400多个基因,占斑马鱼全部基因组的4%。这些基因中,只有109个曾有morpholino报道,551个基因在ZFIN数据库有突变记录(其中有364个基因的突变源自Sanger中心ENU诱变单碱基突变库)。因此,1号染色体上的大部分基因都未有建立有效的突变。

     ZKO项目在无专项经费支持,由各个实验室自筹费用的情况下,对1号染色体上的1020个基因进行了尝试敲除,最终成功构建和保藏了503个基因的700多个突变品系。国家斑马鱼资源中心(CZRC)不仅承担了其中60个编码基因的敲除工作,同时作为项目的协调人,负责该计划产生的ZKO品系数据的整理、核对、品系的收集、鉴定、保藏和共享服务。

   现在,全部ZKO项目构建成功品系都已登记录入ZFIN鱼数据库,服务于全球马鱼研究领域。在ZFIN数据库中搜索关键词“zko”,选择“Mutation/Tg”分类,即可找到全部zko构建品系信息。在CZRC中心网站,ZKO品系的栏目,可以查看更加详尽的相关基因、靶点、突变基因型和鉴定方法等信息。

   如果您需要这些ZKO品系,请参看ZKO品系订购方式说明。

地址:武汉市东湖南路7号中科院水生所; 电话:027-68780570; 网址:http://www.zfish.cn/; 邮箱:zebrafish@ihb.ac.cn
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