中山大学颜庆云组和中科院水生所黄洁组揭示宿主发育压制环境扩散对斑马鱼肠道微生物生态演替的影响

      该研究组首先设计并构建了三种不同的水环境，孵化实验起始前，三种环境理化指标和微生物组成显著差异。随后用三种不同环境的水孵化斑马鱼，12 dph后斑马鱼被分配到三种不同环境中养殖至成鱼。对来自不同孵化环境、不同养殖环境的各发育阶段的斑马鱼肠道微生物进行多样性测序，发现在12dph时各环境的斑马鱼肠道菌群组成高度相似，肠道中大部分高丰度的OTU在对应的水环境中丰度较低。12dph后将斑马鱼进行养殖环境转换进一步测试环境变化对肠道菌群组成的影响，结果表明不论环境是否改变，肠道群落的生态演替主要与斑马鱼发育阶段相关，各发育阶段斑马鱼肠道微生物组成和对应的水环境的差异较大。孵化环境和生长环境转换对斑马鱼肠道菌群组成的影响都不显著，通过对发育阶段、食物和环境等因素对肠道菌群生态演替贡献度的MRT解析发现，发育阶段可解释46.2%的差异。因此，斑马鱼的发育阶段是其肠道菌群演替的主要影响因素，远远超出环境和食物等因素的影响。